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一种新的RNA测序方法:什么是单细胞转录组学?

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wjunxi 发表于 2022-1-10 13:20 | 显示全部楼层 |阅读模式
  单细胞转录组学是下一代RNA测序方法,染色体畸变可以高分辨率查看细胞。


  来自南丹麦大学,惠康桑格研究所和BGI的研究人员在《基因组生物学》杂志上发表了这项研究。


  什么是单细胞转录组学?


  RNA测序使用下一代测序来分析样品中RNA的存在。1,2


  根据南丹麦大学的说法,单细胞转录组学(即scRNA-seq)是一种下一代测序方法,可同时测量单个细胞中数千种基因的信使RNA浓度(由DNA/基因组/遗传蓝图编码)。


  这种新方法可以高分辨率查看细胞,以分析异种细胞群体和单个细胞功能。


  为什么需要一种新的RNA测序方法?


  南丹麦大学指出,尽管存在几种单细胞方案,但传统上是使用Illumina技术和测序平台进行测序的。


  该研究的作者将传统的Illumina平台与用于单细胞转录组学的另一种短读测序平台BGISEQ-500进行了比较。


  BGI论文的主要合作者姜妙苗博士解释说:“更高的通量与每条泳道的成本略有增加的结合,使BGISEQ-500成为scRNA-seq项目的诱人替代品,在scRNA-seq项目中,需要大量的多路复用以及相当大的读取深度每个单元格。”


  映射人类细胞类型以进行健康研究


  江补充说:“这是将Illumina HiSeq与BGISeq-500测序平台进行单细胞RNA测序比较的第一项研究,为研究人员提供了另一种测序选择。我们的研究在平台之间的比较指标中发现非常相似的性能。这对于大规模的单细胞测序计划,生成所有人类细胞类型的参考图谱以及增强我们对人类健康的了解而言将非常有用。”

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